在众多不育患者中，男性不育约占40%，主要是由于精子或精液质量差，甚至少精、无精、死精、畸形精子和精子不液化，导致不育。收集完病史后，医生将进行下一步——体检。病史主要反映患者对自身病情的主观看法(包括许多客观事实)，而常规检查是医生客观地收集男性不育的信息和体征。
一、一般发育状况
身高是否超过两上肢平展后指尖距，上下身体比例是否失衡，身体形态是否异常(苗条、敦实、女性姿势、肥胖、脑心性肥胖)，这些体征大多反映内分泌或代谢状态是否存在问题。营养、肌肉(结实、萎软)和皮肤状况(如痤疮、白斑、发脂多、皮肤紫织)；贫血、浮肿和色素沉着(部位与程度)；声调如何变化；头发状况(阴毛、内脏毛、体毛和胡须厚而无，阴毛是直的还是弯曲的，正常与否)，发际线是否太低；喉结发达还是不明显；是否有乳房女性化和乳头分泌物。这些第二性征的发展可以间接反映性腺功能或雄激素水平。
二、生殖系统的发育状况
阴茎长度、周长、动起后的长度(可以用拉长度代替)、周长、是否有弯曲；表现:是否有硬结、先天性畸形(尿道上裂、尿道下裂、尿道口狭窄)、疤痕、包茎、包皮过长、阴茎肿胀、溃疡、触痛、炎症和海绵触痛。前列腺和精囊检查包括:质地、体积、结节、囊肿、硬结或条索、压痛、中央沟消失或变浅。阴囊检查:透光试验，斜疝，象皮肿，温度，脂肪堆积，睾丸硬结，炎症，层管。硬度、囊感、光滑度、与周围组织粘连、平卧后是否消失以及肿瘤来源。
三、头颈部
1、感官系统包括:色盲、色弱、视野、眼底、嗅觉减弱或缺失以及眼球突出。
2、头部和面部包括中线畸形(如唇裂和跨度)、秃顶、粘液性水肿、肢端肥大症、酒渣鼻、甲状腺(给节和肿胀)和颈蹼。
四、其他部位
1、血压、脉搏、心律、心脏杂音、肺部听诊有无阳性发现。
2、是否有手术疲劳痕迹、腹部肿块、腹股沟淋巴结肿大、腹部和会阴溃疡或疝。
3、骨骼:包括四肢长骨、掌骨和指骨。