乙肝小三阳应检查HBV-DNA（乙肝病毒脱氧核糖核酸）及肝功能，根据具体情况进行综合分析。
1．如果HBV-DNA（应釆用PCR及斑点法同时检测；最好经肝活检证实）为（-）且肝功能、B超及AFP等均长期正常，则说明病毒已清除，无传染性，这种小三阳状态虽然可能延续甚至持续终生，但已无需隔离与治疗。
①可选的非药物疗法如：体育疗法、心理康复疗法等。
②注意不要劳累，调整良好的生活规律，保持好的心态。
③定期到正规医院或专科医院进行复査。
④饮食方面可参见“大三阳”者的饮食控制。
⑤乙肝小三阳患者可以结婚、生育、与健康人一样生活、工作和学习。若配偶乙肝三系均为阴性，建议尽早注射乙肝疫苗，产生HBs抗体后 再结婚、生育为妥，此前性生活男方应使用避孕套；生育后婴儿应在医生指导下注射乙肝疫苗、乙肝免疫球蛋白。
如果HBV-DNA（+）且肝功能异常，说明病毒复制，传染性强，应该采取以抗病毒为主的综合治疗。目前治疗乙肝比较有效的药物有a-干扰素、日达仙、拉米夫定、泛昔洛维、胸腺-5肽等，但这种治疗结果大都限于HBVDNA阴转及减少纤维化，而对其它抗原（包括抗体HBc-IgG,IgM）的进一步阴转影响不大。